直肠炎轻者仅粘膜发炎，重者炎症累及粘膜下层、肌层，甚至直肠周围组织;有时只是一部分直肠粘膜受累，有时直肠粘膜全部发炎，也可累及结肠部分粘膜都有炎症。
1、直肠炎颇为难治，短时期之内少有痊愈的希望。如果长期不愈，容易使致病菌自身产生抗yao性;也可能导致病菌在治疗过程中向上扩散，致使肠道其它部位发生感染。
2、直肠炎发病后，肠道功能遭受破坏，诸如腹痛、腹泻、便秘、肛门肿胀、食欲不振、失眠多梦等不良症状自然会陆续出现。
3、肠狭窄：多发生在病变广泛、病程持续长达5-25年以上的病例，部位多见于左半结肠，乙状结肠或直肠，临床上一般无症状，严重时可引起肠阻塞，出现肠狭窄时，要警惕肿瘤，鉴别良性恶性。
4、中毒性肠扩张：这是本病的一个严重并发症，多发生在全直肠炎的病人，死亡率可高达44%，临床表现为病情迅速恶化，中毒症状明显，伴有腹泻、腹部压痛和反跳痛，肠鸣音减弱或消失，白细胞数增多，易并发肠穿孔。
5、肠息肉：直肠炎超过五年，肠道溃疡面在炎症的长期刺激下容易异常增生，引发肠息肉，一厘米以上肠息肉癌变率极高。
