萎缩性胃炎的主要发病原因：
1、感染因素1983年Warren和Marshall发现，萎缩性胃炎患者，在胃粘液层接近上皮细胞表面有大量幽门螺旋杆菌(campylobacterpylori)存在，其阳性率高达50-80%，有报道此菌并不见于正常胃粘膜。凡该菌定居之处，均见胃粘膜炎细胞浸润，且炎症程度与细菌数量成正相关。电镜也见与细菌相连的上皮细胞表面微突数减少或变钝。
病人血中和胃粘膜中也可找到抗螺旋杆菌抗体。用抗生素治疗后，症状和组织学变化可改善甚或消失。
2、生物性因素慢性传染病如肝炎、结核病等对胃的影响也引起了人们的注意。慢性肝病患者常有慢性胃炎的症状和体征，胃粘膜染色也证实在乙肝病人，胃粘膜内有乙肝病毒的抗原抗体复合物。
3、遗传免疫因素。根据调查，萎缩性胃炎病人的代亲属间，萎缩性胃炎的发病率明显增高，恶性贫血的遗传因素也很明显。有亲戚关系的发病率，比对照组大20倍，说明萎缩性胃炎可能与遗传因素有关。
免疫功能的改变，在萎缩性胃窦炎的发病上已普遍受到重视，特别是患者的血液、胃液或在萎缩粘膜内可找到壁细胞抗体;胃萎缩伴恶性贫血患者血液中，发现有内因子抗体，说明自身免疫反应可能是某些萎缩性胃炎的有关病因。
4、其它胃炎的转归衍生慢性萎缩性胃炎，可由慢性浅表性胃炎发展而来。急慢性浅表性胃炎，胃粘膜病变持久不愈或反复发作，均可形成萎缩性胃炎胃炎。慢性浅表性胃炎的病因均可成为慢性萎缩性胃炎的致病与加重因素。
