慢性萎缩性胃炎的粘膜组织已经发生了萎缩性的改变，是慢性胃炎的一种，引起慢性萎缩性胃炎的原因主要有以下几点：
1、幽门螺杆菌感染：幽门螺杆菌感染科破坏胃肠粘膜组织引起炎症反应，医学证明，其分布与胃内炎症分布一致，幽门螺杆菌可使胃内炎症。同时，如今医学证明，幽门螺杆菌是慢性萎缩性胃炎的主要致病原因。
2、饮食与环境：长期的幽门螺杆菌感染，在部分患者可发生胃粘膜萎缩和肠化生，即发展为慢性多灶萎缩性胃炎，研究显示：饮食中高盐和缺乏新鲜蔬菜水果与胃粘膜萎缩，肠化生即胃癌有着密切的关系。
3、自身免疫系统：自身免疫性胃炎以富含壁细胞的胃体粘膜萎缩为主，患者血清中存在自身抗体。
4、其他：例如幽门括约肌功能不全时含胆汁和胰液的十二指肠液反流入胃，可减弱胃粘膜的屏障功能，酗酒、服用非甾体抗炎药、接触金属、放射、缺铁性贫血、生物因素、体质因素等均可损伤胃粘膜而引起慢性炎症。
